У нас в одном оборудовании было, в регуляторе "CAL-что-то-там" ("квадратик" панельного монтажа), тоже регулярно слетали EEPROM-ки. Они там были припаяны на 2-сторонней плате прямо под импульсным трансформатором питания (по другую сторону платы). Видимо, наводка от него и портила ячейки. Так что у нас было штатное регулярное занятие: "Перезапись ЭСПЗУ"
Потом производитель стал ставить другую модель ЕЕПРОМки, и с ней стало всё в порядке.