По поводу разного времени выполнения команд:
ты сам знаком с цифровой дискретной техникой вообще?
Вся схема синхронизирована одним общим тактовым сигналом, временная стабильность которого, а значит и всей схемы в целом, определяется только стабильностью кварцевого резонатора!
А может быть ты имел в виду задержки на время распространения сигнала по полупроводниковым структурам ? Тогда покажи осцилограф (или лог.анализатор), с помощью которого тебе удалось их измерить
